Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RFTN1Q14699 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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