Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COL9A3Q14050 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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