Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ATRQ13535 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ATRQ13535 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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