Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EFNA3P52797 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EFNA3P52797 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms