Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CENPAP49450 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms