Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHI3L1P36222 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHI3L1P36222 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms