Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALDH4A1P30038 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms