Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GTF2E1P29083 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GTF2E1P29083 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms