Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD46P15529 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD46P15529 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD46P15529 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms