Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXB1P14653 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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