Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SIN3BO75182 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SIN3BO75182 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms