Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRRTM2O43300 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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