Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEPPQ9NTK1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms