Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms