Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ING3-202ENST00000339121 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006222.1-201ENST00000442116 1292 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4P30-201ENST00000450281 899 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008840.1-201ENST00000512486 809 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms