Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRRC1Q96M27 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms