Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00612Q8N6U2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms