Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD163Q86VB7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms