Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ube2q1Q7TSS2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ube2q1Q7TSS2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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