Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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