Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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CLN3Q13286 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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