Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FMODQ06828 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FMODQ06828 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms