Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTDSPL2Q05D32 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms