Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XPCQ01831 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XPCQ01831 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms