Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SEPT2-234ENST00000475474 749 ntTSL 228.56■■■□□ 2.162e-10■■□□□ 12.7
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GTF2F1P35269 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 427.41■■□□□ 1.982e-10■■□□□ 12.7
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GTF2F1P35269 SEPT2-216ENST00000434955 480 ntTSL 326.15■■□□□ 1.782e-10■■□□□ 12.7
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GTF2F1P35269 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)19.53■□□□□ 0.726e-6■■□□□ 12.7
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GTF2F1P35269 ADD2-204ENST00000407644 3741 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.736e-6■■□□□ 12.7
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GTF2F1P35269 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 56.37□□□□□ -1.392e-10■■□□□ 12.7
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GTF2F1P35269 ANGPT1-207ENST00000521950 1177 ntTSL 1 (best)5.69□□□□□ -1.56e-6■■□□□ 12.7
GTF2F1P35269 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 34.9□□□□□ -1.632e-10■■□□□ 12.7
GTF2F1P35269 TRIM56-202ENST00000412507 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.78■□□□□ 0.921e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 TRIM56-204ENST00000487252 735 ntTSL 314.08□□□□□ -0.161e-10■■□□□ 12.6
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GTF2F1P35269 PLCL1-202ENST00000435320 6665 ntTSL 221.3■■□□□ 11e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 PLCL1-205ENST00000487695 3083 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.595e-7■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.665e-7■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.593e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.189e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.599e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 214.34□□□□□ -0.119e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.249e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.379e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 SLC43A3-205ENST00000525205 862 ntTSL 312.08□□□□□ -0.489e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 AP000781.2-202ENST00000529411 681 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.649e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.225e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 ATP11C-209ENST00000485626 643 ntTSL 58.26□□□□□ -1.095e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 PTOV1-215ENST00000600793 426 ntTSL 513.93□□□□□ -0.183e-7■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.54e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.684e-10■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 WDR1-207ENST00000504739 555 ntTSL 317.05■□□□□ 0.325e-8■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 WDR1-210ENST00000506246 572 ntTSL 517.05■□□□□ 0.325e-8■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 514.58□□□□□ -0.075e-8■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.812e-8■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 ACTG1-204ENST00000571721 813 ntTSL 521.26■□□□□ 0.992e-8■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-8■■□□□ 12.6
GTF2F1P35269 ACTG1-209ENST00000575659 742 ntTSL 319.37■□□□□ 0.692e-8■■□□□ 12.6
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