Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR1EP28566 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms