Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX2P28328 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX2P28328 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms