Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRHP20396 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRHP20396 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRHP20396 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRHP20396 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRHP20396 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRHP20396 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRHP20396 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms