Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI2P10070 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI2P10070 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI2P10070 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI2P10070 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI2P10070 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms