Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLBP06746 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLBP06746 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLBP06746 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLBP06746 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms