Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOA1P02647 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOA1P02647 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
APOA1P02647 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOA1P02647 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOA1P02647 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms