Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN9O95484 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms