Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GMDSO60547 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GMDSO60547 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GMDSO60547 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GMDSO60547 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms