Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPLO60437 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPLO60437 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPLO60437 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPLO60437 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPLO60437 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms