Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPJQ9HC77 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms