Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXQ1Q9C009 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXQ1Q9C009 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXQ1Q9C009 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXQ1Q9C009 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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