Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IFT27Q9BW83 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFT27Q9BW83 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms