Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TCF12Q99081 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TCF12Q99081 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms