Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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GTF3C6Q969F1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF3C6Q969F1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GTF3C6Q969F1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
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