Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC12Q8WUD4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms