Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf17Q53FE4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms