Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIP4Q15650 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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