Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms