Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTGDRQ13258 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms