Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRSF6Q13247 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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