Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHAF1BQ13112 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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