Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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STRN3Q13033 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
STRN3Q13033 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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