Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SLC3A1Q07837 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms