Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms