Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTCQ00610 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms